Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms