Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx29Q9D3S3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms