Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z4

Senp8, Sentrin-specific protease 8, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp8Q9D2Z4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp8Q9D2Z4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp8Q9D2Z4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms