Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms