Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms