Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SarnpQ9D1J3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms