Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf4Q9D1H6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms