Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ube2cQ9D1C1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ube2cQ9D1C1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ube2cQ9D1C1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ube2cQ9D1C1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ube2cQ9D1C1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ube2cQ9D1C1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ube2cQ9D1C1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ube2cQ9D1C1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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