Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms