Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ift27Q9D0P8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ift27Q9D0P8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ift27Q9D0P8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ift27Q9D0P8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ift27Q9D0P8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ift27Q9D0P8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ift27Q9D0P8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ift27Q9D0P8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ift27Q9D0P8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ift27Q9D0P8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift27Q9D0P8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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