Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpsap1Q9D0M1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms