Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acsl3Q9CZW4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acsl3Q9CZW4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acsl3Q9CZW4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acsl3Q9CZW4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acsl3Q9CZW4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms