Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms