Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms