Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thumpd2Q9CZB3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms