Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl55Q9CZ83 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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