Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms