Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gins3Q9CY94 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gins3Q9CY94 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gins3Q9CY94 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gins3Q9CY94 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gins3Q9CY94 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms