Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtpbp8Q9CY28 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gtpbp8Q9CY28 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp8Q9CY28 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gtpbp8Q9CY28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtpbp8Q9CY28 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp8Q9CY28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtpbp8Q9CY28 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtpbp8Q9CY28 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gtpbp8Q9CY28 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gtpbp8Q9CY28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp8Q9CY28 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms