Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms