Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms