Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pin4Q9CWW6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms