Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cnot11Q9CWN7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cnot11Q9CWN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cnot11Q9CWN7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Cnot11Q9CWN7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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