Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF6

Bbs2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs2Q9CWF6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs2Q9CWF6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs2Q9CWF6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms