Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms