Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snw1Q9CSN1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snw1Q9CSN1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms