Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CRC3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CRC3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms