Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CR55 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CR55 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CR55 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CR55 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CR55 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CR55 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CR55 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms