Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DenrQ9CQJ6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms