Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms