Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms