Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms