Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQ90 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQ90 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms