Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ubl4bQ9CQ84 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms