Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms