Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ3

Uncharacterized protein C1orf185 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPZ3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CPZ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms