Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg3Q9CPX6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms