Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms