Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms