Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms