Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ0

Ntm, Neurotrimin, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NtmQ99PJ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NtmQ99PJ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NtmQ99PJ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms