Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms