Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms