Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms