Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcgf6Q99NA9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms