Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms