Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mccc1Q99MR8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms