Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a9Q99MR3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a9Q99MR3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms