Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pink1Q99MQ3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pink1Q99MQ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pink1Q99MQ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pink1Q99MQ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pink1Q99MQ3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pink1Q99MQ3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pink1Q99MQ3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pink1Q99MQ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pink1Q99MQ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pink1Q99MQ3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pink1Q99MQ3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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