Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms